新疆出入境邊防檢查總站下轄16個出入境邊防檢查站，10個邊境管理支隊，前身為新疆公安邊防總隊，是一支聽黨指揮、英勇善戰、堅韌擔當、功勛卓著的光榮隊伍。自組建70年來，一代代官兵扎根大漠邊關、駐守雪域高原，建設邊境立體防控體系，主動參與國際維和，深化固邊興邊工作，牢牢守護著新疆5700多公里邊境線和20.8萬平方公里邊境轄區的安全。部隊涌現出了被國務院、中央軍委授予“模范邊防檢查站”榮譽稱號的紅其拉甫邊檢站，連續六次被國務院評為“全國民族團結進步模范集體”，被公安部、共青團中央授予“青年文明號”的下馬崖邊防派出所以及全國特級優秀人民警察張永周、“十大衛國戍邊英模”艾尼瓦爾·努爾頓、新疆最美警察肖合來提等模范集體和個人。